微软开源逆合成模型 RetroChimera,成果发表于《自然》
微软研究院在《自然》发表逆合成预测框架 RetroChimera,通过集成两个互补模型并学习排序,提升小分子合成路线预测质量,并已开源实现与权重。
微软发布逆合成预测框架 RetroChimera
微软研究院在博客中介绍,其逆合成模型 RetroChimera 的相关论文已发表于《自然》。据该博客描述,RetroChimera 是一个面向小分子合成路线预测的框架,由两个模型组成:基于 Transformer 的从头预测模型 R-SMILES 2,以及基于图神经网络、依赖反应模板的 NeuralLoc。框架通过“学习排序”的集成策略,为两个子模型的预测分配与排名相关的投票,当两者给出相同反应时投票相加,从而综合二者互补的化学模式。
背景与影响
博客指出,新药与新材料的研发依赖新分子的合成,但合成路线规划目前仍大量依赖人工,耗时且成本较高,也是药物开发成本的重要来源。逆合成从目标分子出发,逐步拆解为更简单的前体,直至可购买的基础砌块。微软方面称,RetroChimera 在常见与罕见反应类别上表现较强,其预测更贴近化学家的判断;在盲测中,博士级化学家更偏好该模型给出的单步反应预测。博客还提到,在十个挑战性目标的完整路线评估中,RetroChimera 成功九个,而从头模型为五个、编辑模型为四个、基线模型 NeuralSym 为两个。微软表示,该模型有望帮助研究人员更高效地识别合成路线,并配合实验室自动化,推动合成规划与执行的闭环系统。
限制与来源
上述性能与评估结论均来自微软研究院博客及所引论文的表述,本文未做独立验证。博客称 RetroChimera 已在 GitHub 开源(MIT 许可证),并可通过 Microsoft Foundry 访问,具体获取方式、可用范围与许可条款请以官方仓库和官网当前信息为准。该博客未披露定价、地区可用性等细节,相关功能与支持情况亦需以官方最新说明为准。